Per individuare l’influenza A è necessario raccogliere un campione di secrezioni respiratorie (tramite un tampone nasale o faringeo) entro i primi 4-5 giorni dalla comparsa dei sintomi (quando l'infezione è più virulenta). Alcune persone, in particolar modo i bambini, possono espellere virus anche per 10 giorni e più.
L'identificazione del virus richiede l'invio del campione ad un laboratorio di riferimento: compete al medico indirizzare l'eventuale caso sospetto al laboratorio di riferimento.